MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc kimchii IMSNU 11154 plasmid LkipL4701

Total Repeats: 356

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014131	ATT	2	6	990	995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
2	NC_014131	TTA	3	9	1077	1085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	295987466
3	NC_014131	AAAG	2	8	1167	1174	75 %	0 %	25 %	0 %	295987466
4	NC_014131	CTT	2	6	1186	1191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987466
5	NC_014131	TA	4	8	1211	1218	50 %	50 %	0 %	0 %	295987466
6	NC_014131	GTAC	2	8	1248	1255	25 %	25 %	25 %	25 %	295987466
7	NC_014131	ATC	2	6	1280	1285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	295987466
8	NC_014131	AT	3	6	1295	1300	50 %	50 %	0 %	0 %	295987466
9	NC_014131	AAG	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987466
10	NC_014131	ATA	2	6	1369	1374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
11	NC_014131	T	7	7	1375	1381	0 %	100 %	0 %	0 %	295987466
12	NC_014131	ATA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987466
13	NC_014131	TAAAAA	2	12	1481	1492	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	295987466
14	NC_014131	A	7	7	1488	1494	100 %	0 %	0 %	0 %	295987466
15	NC_014131	CTAATT	2	12	1525	1536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	295987466
16	NC_014131	A	6	6	1545	1550	100 %	0 %	0 %	0 %	295987466
17	NC_014131	TAG	2	6	1586	1591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987466
18	NC_014131	GAA	2	6	1710	1715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
19	NC_014131	ATG	2	6	1776	1781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987467
20	NC_014131	AGA	2	6	1805	1810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987467
21	NC_014131	AT	3	6	1815	1820	50 %	50 %	0 %	0 %	295987467
22	NC_014131	ATA	2	6	1852	1857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
23	NC_014131	AAT	2	6	1980	1985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987467
24	NC_014131	ATTG	2	8	2142	2149	25 %	50 %	25 %	0 %	295987468
25	NC_014131	TGA	2	6	2208	2213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
26	NC_014131	AGT	2	6	2298	2303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987468
27	NC_014131	ATA	2	6	2336	2341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
28	NC_014131	T	6	6	2346	2351	0 %	100 %	0 %	0 %	295987468
29	NC_014131	AGA	2	6	2376	2381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987468
30	NC_014131	AT	3	6	2388	2393	50 %	50 %	0 %	0 %	295987468
31	NC_014131	GAATT	2	10	2411	2420	40 %	40 %	20 %	0 %	295987468
32	NC_014131	AAT	2	6	2445	2450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987468
33	NC_014131	AAACA	2	10	2459	2468	80 %	0 %	0 %	20 %	295987468
34	NC_014131	A	6	6	2569	2574	100 %	0 %	0 %	0 %	295987469
35	NC_014131	AAT	2	6	2587	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
36	NC_014131	TGAA	2	8	2649	2656	50 %	25 %	25 %	0 %	295987469
37	NC_014131	ATTG	2	8	2674	2681	25 %	50 %	25 %	0 %	295987469
38	NC_014131	AAG	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987469
39	NC_014131	AAT	2	6	2782	2787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987469
40	NC_014131	TGA	2	6	2941	2946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
41	NC_014131	GAT	2	6	2995	3000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987469
42	NC_014131	ACA	2	6	3031	3036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987469
43	NC_014131	A	8	8	3251	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	295987470
44	NC_014131	ACCA	2	8	3266	3273	50 %	0 %	0 %	50 %	295987470
45	NC_014131	GCT	2	6	3277	3282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987470
46	NC_014131	TGAA	2	8	3462	3469	50 %	25 %	25 %	0 %	295987470
47	NC_014131	TCT	2	6	3569	3574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987470
48	NC_014131	TTG	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987470
49	NC_014131	AGC	2	6	3819	3824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987470
50	NC_014131	T	6	6	4037	4042	0 %	100 %	0 %	0 %	295987470
51	NC_014131	TCC	2	6	4102	4107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	295987471
52	NC_014131	TGAC	2	8	4155	4162	25 %	25 %	25 %	25 %	295987471
53	NC_014131	GCTT	2	8	4183	4190	0 %	50 %	25 %	25 %	295987471
54	NC_014131	CTT	2	6	4256	4261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	295987471
55	NC_014131	TTCT	2	8	4523	4530	0 %	75 %	0 %	25 %	295987472
56	NC_014131	GTTT	2	8	4577	4584	0 %	75 %	25 %	0 %	295987472
57	NC_014131	T	6	6	4582	4587	0 %	100 %	0 %	0 %	295987472
58	NC_014131	AAC	2	6	4599	4604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987472
59	NC_014131	GAA	2	6	5283	5288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
60	NC_014131	T	6	6	5322	5327	0 %	100 %	0 %	0 %	295987473
61	NC_014131	A	7	7	5365	5371	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
62	NC_014131	CGT	2	6	5435	5440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
63	NC_014131	TGA	2	6	5444	5449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987473
64	NC_014131	AAG	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
65	NC_014131	A	6	6	5537	5542	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
66	NC_014131	TGC	2	6	5545	5550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987473
67	NC_014131	A	6	6	5613	5618	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
68	NC_014131	A	6	6	5642	5647	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
69	NC_014131	AT	3	6	5776	5781	50 %	50 %	0 %	0 %	295987473
70	NC_014131	GAA	2	6	5843	5848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
71	NC_014131	AGA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
72	NC_014131	GAAA	2	8	5948	5955	75 %	0 %	25 %	0 %	295987473
73	NC_014131	AACAGC	2	12	5986	5997	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	295987473
74	NC_014131	TATGC	2	10	6003	6012	20 %	40 %	20 %	20 %	295987473
75	NC_014131	GAA	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987473
76	NC_014131	CTCA	2	8	6105	6112	25 %	25 %	0 %	50 %	295987473
77	NC_014131	A	6	6	6117	6122	100 %	0 %	0 %	0 %	295987473
78	NC_014131	GAC	2	6	6149	6154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987473
79	NC_014131	TAGAT	2	10	6191	6200	40 %	40 %	20 %	0 %	295987473
80	NC_014131	AATC	2	8	6227	6234	50 %	25 %	0 %	25 %	295987473
81	NC_014131	AC	3	6	6818	6823	50 %	0 %	0 %	50 %	295987474
82	NC_014131	GTC	2	6	6849	6854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	295987474
83	NC_014131	ATA	2	6	6859	6864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
84	NC_014131	T	7	7	6995	7001	0 %	100 %	0 %	0 %	295987474
85	NC_014131	AATGAT	2	12	7008	7019	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	295987474
86	NC_014131	A	6	6	7048	7053	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
87	NC_014131	T	7	7	7067	7073	0 %	100 %	0 %	0 %	295987474
88	NC_014131	A	6	6	7080	7085	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
89	NC_014131	CTTA	2	8	7192	7199	25 %	50 %	0 %	25 %	295987474
90	NC_014131	AGTA	2	8	7257	7264	50 %	25 %	25 %	0 %	295987474
91	NC_014131	AAT	2	6	7268	7273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987474
92	NC_014131	GAC	2	6	7333	7338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
93	NC_014131	GAA	2	6	7341	7346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
94	NC_014131	A	6	6	7515	7520	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
95	NC_014131	GCA	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	295987474
96	NC_014131	GAT	2	6	7572	7577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
97	NC_014131	GAT	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987474
98	NC_014131	AAG	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987474
99	NC_014131	TTG	2	6	7701	7706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	295987474
100	NC_014131	AT	3	6	7709	7714	50 %	50 %	0 %	0 %	295987474
101	NC_014131	AT	3	6	7823	7828	50 %	50 %	0 %	0 %	295987474
102	NC_014131	A	6	6	7878	7883	100 %	0 %	0 %	0 %	295987474
103	NC_014131	TGA	2	6	7965	7970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
104	NC_014131	TA	3	6	8049	8054	50 %	50 %	0 %	0 %	295987475
105	NC_014131	TAG	2	6	8154	8159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987475
106	NC_014131	A	7	7	8171	8177	100 %	0 %	0 %	0 %	295987475
107	NC_014131	AAC	2	6	8222	8227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
108	NC_014131	A	6	6	8233	8238	100 %	0 %	0 %	0 %	295987475
109	NC_014131	CAA	3	9	8317	8325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
110	NC_014131	A	6	6	8344	8349	100 %	0 %	0 %	0 %	295987475
111	NC_014131	AGA	2	6	8355	8360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
112	NC_014131	AAC	2	6	8394	8399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987475
113	NC_014131	AGA	2	6	8400	8405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
114	NC_014131	TAA	2	6	8406	8411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987475
115	NC_014131	AGA	2	6	8421	8426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987475
116	NC_014131	TGG	2	6	8473	8478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	295987475
117	NC_014131	ATA	2	6	8522	8527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
118	NC_014131	GAA	2	6	8529	8534	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
119	NC_014131	TGAA	2	8	8546	8553	50 %	25 %	25 %	0 %	295987476
120	NC_014131	AAAATA	2	12	8596	8607	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	295987476
121	NC_014131	A	6	6	8660	8665	100 %	0 %	0 %	0 %	295987476
122	NC_014131	ATTT	2	8	8696	8703	25 %	75 %	0 %	0 %	295987476
123	NC_014131	A	6	6	8726	8731	100 %	0 %	0 %	0 %	295987476
124	NC_014131	AAG	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	295987476
125	NC_014131	AT	3	6	8876	8881	50 %	50 %	0 %	0 %	295987476
126	NC_014131	TGA	2	6	8949	8954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
127	NC_014131	ACA	2	6	8959	8964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	295987476
128	NC_014131	T	6	6	8996	9001	0 %	100 %	0 %	0 %	295987476
129	NC_014131	ATA	2	6	9002	9007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
130	NC_014131	AAT	2	6	9067	9072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
131	NC_014131	TGA	2	6	9084	9089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
132	NC_014131	ATA	2	6	9110	9115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
133	NC_014131	AT	3	6	9173	9178	50 %	50 %	0 %	0 %	295987476
134	NC_014131	TAA	2	6	9399	9404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
135	NC_014131	AAT	2	6	9448	9453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
136	NC_014131	AAT	2	6	9460	9465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	295987476
137	NC_014131	ATG	2	6	9503	9508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	295987476
138	NC_014131	AAAT	2	8	9569	9576	75 %	25 %	0 %	0 %	295987476
139	NC_014131	TGAT	2	8	9599	9606	25 %	50 %	25 %	0 %	295987476
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.